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CHIMIE ORGANIQUE

23 mars 2008

BIBLIOGRAPHIE

Pourquoi est-ce que le thé change de couleur en présence de citron ? :

- Heim & Al 2002
- The New Scientist
- Cours de chimie organique HEI3, Philippe Gautret


Pourquoi est-ce que le papier sulfurisé n'absorbe pas l'eau ? :

- Que sais-je?, Edition PUF, L.-J. Olmer
  Le papier et les dérivés de la cellulose


Pourquoi est-ce que l'oeuf durcit ? :


- Biologie du développement de Scatt F. Gilbert, publié en 2004, De Boek Université

- Les secrets de la casserole, Hervé This

- Abrégé de la biochimie alimentaire, Charles Alais et Guy Linden

- Chimie dans la maison, Dominique Grouzte-Deprost

- De la science aux fourneaux, Hervé This

- Traité de chimie organique, K. Peter C. Vollhardt, Neil E. Schore

- Cours de chimie organique HEI4, Philippe Gautret


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22 mars 2008

Pourquoi est-ce qu'un oeuf durcit ?

Lorsque l'on chauffe un composé, il se produit un changement d'état, en général du solide vers le liquide, ou du liquide vers le gazeux.

La coagulation de l'œuf semble être une situation paradoxale au regard des phénomènes de fusion et d'évaporation.

Que se passe-t-il au niveau microscopique ?

1- Qu'est-ce qu'une protéine ?

prot_ine

On décrit une protéine en parlant de quatre structures :


-> Structure Primaire
:

La structure primaire d'une protéine est l'enchaînement des acides aminés qui la composent :

~ Acide Aminé :
Un acide aminé est une molécule possédant une fonction acide carboxylique et un groupe amino en alpha de la fonction acide. Soit :

acide_amin_

La structure primaire d'une protéine s'écrit donc en utilisant les abréviations des acides aminés :

~ Chaîne d'acides aminés liés par liaisons peptidiques :
-Gly-Val-  (ici : glycine, valine ...)

-> Structure secondaire :

La structure secondaire est un arrangement à courtes distances de la chaîne peptidique. On distingue l'hélice alpha, le feuillet plissé bêta et le coude bêta turn.

Ces arrangements à courte distance ont une cohésion due à des interactions faibles, telles que les liaisons hydrogènes entre l'oxygène de la fonction acide et l'hydrogène du groupe amine d'un autre acide aminé

-C=O---H-N-

~ Hélice alpha :

h_lice_alpha

Structure compacte.

Stabilisée par des liaisons hydrogène entre l'atome d'oxygène de C=O et l'atome d'hydrogène de N-H.

Radicaux à l'extérieur de l'hélice.


~ Feuillet plissé :

feuillet_beta

Liaisons hydrogène entre les mêmes groupements que précédemment, sauf qu'elles s'établissent entre deux segments différents.

-> Structure tertiaire :

C'est l'arrangement spatial des structures secondaires qui aboutit à une forme globale spécifique de la protéine. Cette structure est maintenue par différents types d'interactions (voir les groupements entourés en bleu).

-> Structure quaternaire :

Ce sont les protéines qui s'organisent en agrégats (pelotes).


2- Comment cuit un oeuf ?

Avec l'augmentation de la température, il y a dénaturation des protéines, c'est-à-dire que les liaisons hydrogènes se cassent. Il y a alors un réarrangement de la structure tertiaire des protéines.

a) Formation de ponts disulfure

Un pont disulfure est un lien covalent dort, qui se forme par oxydation des deux fonctions thiols de deux cystéines, dans une protéine.

cystine2

b) La coagulation

Lors de l'augmentation de température, les protéines se déplient, deviennent linéaires et se lient entre elles en emprisonnant les molécules d'eau. Ce phénomène correspond à la coagulation.


AB

On élève la température :

C

On a dénaturation d'un certain type de protéines. Il y a formation d'un petit réseau de protéines dénaturées qui retiennent un peu d'eau. L'œuf commence à se solidifier légèrement les molécules d'eau deviennent moins mobiles.

On élève à nouveau la température :

D

On a dénaturation supplémentaire d'un autre type de protéines. Le réseau de protéines se densifie et retient encore de l'eau. Les molécules perdent de leur mobilité et l'œuf se durcit davantage.

On élève à nouveau la température :

E

On a dénaturation supplémentaire d'un autre type de protéine. Le réseau est encore plus dense et retient encore plus de molécules d'eau. Les molécules perdent réellement de leur mobilité, l'œuf est presque totalement dur.

On élève encore la température :

F

Le dernier type de protéine se dénature. Le réseau de protéines dénaturées est très dense, les molécules d'eau sont retenues par les protéines. Elles ne sont plus mobiles (ou très peu). L'œuf est totalement cuit.

Nous avons compris maintenant le mécanisme de la cuisson de l'œuf, réalisons une petite expérience :
- dans un four à 55°C, on place un œuf pendant 3minutes ;
- dans un four à 55)C, on place un œuf pendant 3jours.
Lequel des deux œufs sera le plus cuits ?
Aucun des deux ! Seule une augmentation de température permet le dépliement de toutes les protéines et leurs liaisons par des ponts disulfures. Pour cuire un œuf, cela de sert à rien de le laisser très longtemps cuire, il suffit juste de le laisser à une température suffisamment élevée pour provoquer la coagulation, donc la dénaturation des protéines, leurs liaisons par les ponts disulfures et l'emprisonnement des molécules d'eau.


3- Comment décuit un oeuf ?

Pourquoi un œuf dur, et cuit, mis dans du vinaigre, devient liquide ?

C'est la rupture des ponts disulfures qui provoque la décuisson de l'œuf.


cystine Cystine

La rupture de la liaison -S-S- s'effectue selon le mécanisme suivant :

disulfure

Cette séparation a lieu grâce à la présence du vinaigre qui libère des ions H+, ce qui permet d'avoir un milieu acide.

Les protéines de l'œuf sont donc séparées, il n'y a plus de cohésion entre elles. Par ce phénomène chimique, on procède à la décuisson de l'œuf.

On peut conclure que ce sont les ponts disulfures qui sont responsables de la cuisson de l'œuf.

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21 mars 2008

Pourquoi le papier sulfurisé n'absorbe pas l'eau ?

1- Qu'est-ce que le papier ?

La papier est composé principalement de cellulose provenant des végétaux.
La composition de la cellulose est exprimée par la formule C6H1005 (formule brute). Mais la molécule est plus compliquée et pour la représenter, il faut affecter cette formule à un facteur n.

image1
Ceci nous donne en écriture développée :

23521467

Cette longue chaîne est obtenue par polymérisation. Quelque soit la matière première végétale employée, la première phase de la fabrication du papier est l'obtention d'une pâte :

hachage

li____cellulose 

Hachage

image_reli__a_la_cellulose

Fabrication du papier à partir de la cellulose

Une fois la pâte de cellulose obtenue, elle est pressée, séchée et mise sous rouleau.


2- Le phénomène de capillarité

ph_no_capillarit_

Légende : "- - - - -" = liaison hydrogène.

De même que l'eau se diffuse le long du papier, elle se propage dans la plante, des racines jusqu'au sommet.
Le  phénomène de capillarité est la migration d'un liquide dans un milieu. (ex : dans une plante). Ceci s'explique par le fait que la plante est composée de cellulose qui grâce à ses groupes hydroxyles (-C-OH), forme des liaisons hydrogènes avec la molécule d'eau.

Grâce à ces liaisons hydrogènes, la cellulose absorbe assez facilement l'eau et elle se gonfle lorsqu'elle est plongée dans ce liquide.

Ref. Encyclopedia Britannica 1768


3- Pourquoi le papier sulfurisé n'absorbe pas l'eau ?

Le "papier cuisson" est obtenu par le processus de sulfurisation d'où son nom le papier sulfurisé.

image7

La papier sulfurisé est obtenu par une action rapide de l'acide sulfurique à 60°C sur la cellulose du papier (2H+ + SO42-). Ceci produit une hydrolyse partielle sur la cellulose et gélifie la surface des fibres : celles-ci se soudent alors entre elles et renferment les pores du papier.

cellulose_r_action_1

Ensuite la bande de papier continue son chemin dans une cuve contenant une base (l'ammoniac NH3, ou la soude NaOH) : l'acide restant sur le papier va alors être neutralisé.

NH3

Puis le papier sulfurisé recouvert de NH4+ va être rincé abondamment dans des cuves contenant de l'eau afin d'éliminer parfaitement le liquide corrosif dont l'action prolongée détruirait la cellulose. De plus, l'eau élimine les ions comme NH4+ et SO42-.
Pour finir le papier est séché. Il a alors une structure continue (fibres soudées, pores bouchées) qui lui confère la propriété particulière de ne plus absorber l'eau. En effet, la cellulose ne peut plus former de liaisons H avec l'eau, les molécules de H20 glissent alors à la surface du papier.

Cette réaction de l'acide avec la cellulose entraîne la formation d'un ester. Or la liaison -O- se forme en arrière du plan de la surface du papier. L'oxygène se retrouve alors dans la fibre et non à la surface de la cellulose. Il ne peut alors plus interagir avec l'eau en formant des liaisons O-H.

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20 mars 2008

Pourquoi est-ce que le thé change de couleur en présence de citron ?

evo_th_2

1- Pourquoi une molécule est colorée ?

Les électrons sont répartis sur les couches.

23549954Animation1Cliquez sur les images pour voir les deux animations

Absorption d'une longueur d'onde dans le visible

Plus le système est conjugué et plus la variation de E est faible, donc plus la transition est facilitée et spontanée. Ce qui implique qu’une molécule avec un système p conjugué est colorée

Exemples de molécules conjuguées

Beta_carotene


2- Qu’est-ce qu’un indicateur coloré ?

Définition : Un indicateur coloré de pH est un composé qui change de structure chimique et donc de couleur selon la valeur du pH de la solution dans laquelle on le place.

Exemple de la phénolphtaléine

Ph_nolphtal_ine

La forme acide ne possède pas de conjugaison entre les cycles, c’est donc une molécule incolore.

La forme basique possède un système p conjugué : c’est un molécule colorée (rose).


m_ca

indicateurcolor_1

indicateurcolor_2

source Wikipedia(c)


3- Couleur du thé et influence du citron :

Les molécules responsables de la coloration du thé sont les polyphénols.

ph_nol

La catéchine constitue le principal polyphénol du thé.

cat_chine

L’ajout du citron, acide, modifie la structure de la molécule de catéchine par l’apport de H+.

Hypothèse de mécanisme

23525336

La molécule obtenue à un système p différent, donc sa coloration sera différente.


4- Autres applications :

Exemple du vin :

23525983

Le même phénomène est observable et s’explique par la présence de molécules d’anthocyanine.

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19 mars 2008

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